他非常聪明，不管
们觉得他有什
不足，他在几个月内就能纠正过来，显然他对行政管理
解远胜于们。无论们有哪些疑虑，也不管它们是因何而起，他都能很快处理好。”到1943年夏，威尔逊发觉：“当和他在
起时候，感觉自己也更高大……变成奥本海默崇拜者，视他为偶像……看法彻底改变。”
即便如此，在项目早期规划中，奥本海默经常天真得令人难以置信。在他给曼利组织架构图上，他把自己列为实验室主任和理论物理学部门负责人。但他同事们很快就发现，他根本无暇同时完成这两项工作，最后奥本海默自己也发现这点，于是他任命汉斯·贝特负责理论物理学部门。奥本海默还曾告诉格罗夫斯将军，他只需要几位科学家。达德利少校说，他们第次勘查此地时，奥本海默说他认为6名科学家加上些工程师和技术人员可以完成这项工作。虽然这说法有夸张之嫌，但是有点是显而易见：开始奥本海默大大低估这项工作规模。最初建设合同预算为30万美元，但不到年时间就花掉750万美元。
到1943年3月洛斯阿拉莫斯开放时，这个新社区集中100名科学家、工程师和后勤人员；不到6个月，这个数字就变成1000人；年之后，在这块台地上生活着3500人。到1945年夏，奥本海默选择这片荒野已经发展为座小镇，至少有4000名平民和2000名军人住在这里，他们分别生活在300幢公寓、52座宿舍和大约200辆拖车里。仅封闭管理“技术区”就有37栋建筑，包括个钚提纯工厂、个铸造厂、座图书馆、个礼堂，还有几十间实验室、仓库和办公室。
让几乎所有同事都感到诧异是，起初奥本海默竟然接受格罗夫斯将军项建议，即新实验室所有科学家都应该入伍成为受委任陆军军官。1943年1月中旬，奥本海默访问位于旧金山普雷西迪奥陆军基地，他此行是为接受中校委任。实际上，他还参加军队体检，但没有通过。陆军军医报告说，奥本海默体重128磅，比最低体重要求轻11磅，比他这个年龄和身高理想体重低27磅。他们注意到他有“慢性咳嗽”，这种情况可以追溯到1927年，当时他胸部X光片证实他患有肺结核。他还报告“腰骶部劳损”病史：他说，大约每隔10天，他就会感到左下肢轻微阵痛。鉴于上述原因，军医认为他“终身丧失服役能力”。但是格罗夫斯已经吩咐医生奥本海默必须获准履职，所以
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