由于疫情发现得及时，萧彧又足够重视，防疫措施非常严格，天花疫情并没有蔓延开来，只有客栈、医馆以及与零号病人同船的客商中出现了感染病例。
但这也足够令人头疼，因为天花无有效药物，死亡率非常高，重症天花几乎是每三个人就会死一个。
自从发现天花疫情，萧彧的心就揪着，因为思归就在隔离的医馆，还跟零号病人有密切接触，他是最容易被感染的人群。
这是呼吸道传染病，就目前这种简陋的防护办法，他被感染上只会是时间问题。
思归是他从小看到大的，至今还不到十六岁，孟洪就这么一个儿子，万一有个三长两短，他怎么跟他交代。
官府在最短的时间内将病人住过的客栈和医馆都密切监控起来,就地隔离，不再允许人随意进出。
与病人搭乘一条船的乘客以及与这些人的密切接触者也全都找出来，统一隔离观察。
城外的人也尽量杜绝进城,蔬菜水果鱼肉由官府统一采购,再按等份分好,挨家挨户送货上门，不能挑选，一份不够买两份,两份不够多买几份。
危机时刻，要求大家都能理解,官差态度也尽量要好一点，食民俸禄，该为民办事了。
防疫一事由萧彧亲自调控安排，孙非配合他的指令组织防疫活动。
就在无比焦虑之际，萧彧猛然一拍脑袋，牛痘是天花的克星，人要是患了牛痘，就能对天花实现永久性的免疫，要是能找到牛痘，给思归以及医馆的人种上，那就可以免疫天花了。
萧彧急忙叫来裴凛之，跟他说明了情况：“你从军中派人去寻找患了牛痘的牛，然后将病牛带回来。”
裴凛之对牛痘治天花一事闻所未闻，说：“牛痘真的能治疗天花？”
萧彧说：“不能治，但是能防。在我们那里，天花是唯一被完全消灭掉的病毒，就是通过接种疫苗来防治的。等找到牛痘，就给医馆和客栈那些未患病的人都种上牛痘。我们也都种上，这样就不用再担心被天花传染上了。而且只要种上牛
官府集会活动都停止，包括上早朝、练兵，当前唯一要务便是控制疫情。
官兵二十四小时于街巷中巡逻,百姓一旦出现有发热、畏寒、乏力、皮肤斑疹丘疹等症状者,都要第一时间跟官兵报备，进行隔离治疗。
外来商船根据发船地点统一安排,来自北边的,要进行隔离观察,其他地区的,则要暂住船上等待疫情结束。
短短两天时间内,番禺城就完全进入了防疫状态，店铺关门,街上再无人随意走动。
番禺城外的村庄也发布了通告,这几日有进城的,都要进行居家隔离，一旦有发病症状，要汇报里正。由里正通知官府，官府安排治疗观察。
