这段时间是曾国藩
生最痛苦
时期之。他白天频繁联系各处，全力保障曾国荃供应，傍晚到后院小房间里去，跪在蒲垫上默默对天祷告，求老天保佑弟弟平安。上
床又常常夜无眠，沈葆桢此举如同扎在他心上根刺，每翻身，都感到钻心地痛。
内心愤怒纠缠如此，但是曾国藩外在反应却没有任何失态之处。
早在同治元年（1862），因为与当时江西藩司闹矛盾，曾国
。沈葆桢却不想成为个把命运交由别人去掌握人，曾国藩虽然承诺由湘军保卫江西安全，然而军事瞬息万变，救援岂能总是那
及时？因此他反以前历任做法，不顾曾国藩反对，开始招兵买马，决心要建立起支自己军队。然而，供养军队需要大量金钱。这就和曾国藩需要发生冲突。沈葆桢因此决定每个月截留四万两漕折，用于建设本省军队。
沈葆桢截留四万两军饷本来已经出格，更为出格是，沈葆桢在做出这决定之前，并没有和曾国藩商量过。因此曾国藩后来说沈氏“既不函商，又不咨商，实属不近人情”(16)。沈葆桢为什不打招呼呢？因为他知道自己独立建军做法是违反曾国藩指示，因此干脆不商而行。所以后来朝廷在公文中也指出：“沈葆桢……未经先与曾国藩商酌办理，似疑曾国藩不允所商而然。”(17)
事出意外，曾国藩下子陷入焦虑之中。九月十三日，曾国藩在日记当中说：
又未接沅弟信，忧灼之至。又因沈中丞奏截留江西漕折，银两每月少此四万，士卒更苦，焦虑无已。(18)
沈葆桢此举，实在是恩将仇报。曾国藩第反应当然是愤怒。维系湘军集团，就是两个字—恩与义。虽然曾国藩举荐他人，从不是为让他们报答自己私恩，但是也从来没有想到自己举荐之人会成为自己敌人。
他心情恶劣到极点，在日记中记道：
以江西抚、藩二人似有处处与
为难之意，寸心郁郁不自得。因思日内以金陵、宁国危险之状，忧灼过度。又以江西诸事掣肘，闷损不堪。(19)
因为江西巡抚和管财政布政使两个人似乎处处与为难，令心中抑郁不自得。本来因为南京和宁国军事危局忧灼不已，现在又因为江西*员掣肘而闷损不堪。
三更睡，五更醒，展转不能成寐，盖寸心为金陵、宁国之贼忧悸者十分之八，而因僚属不和顺、恩怨愤懑者亦十之二三。(20)
三更睡下，五更又醒，在床上辗转反侧，不能成寐。十分之八是因为南京、宁国战事紧张而担忧，十分之二三是因为与属下恩恩怨怨而愤懑。
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