外和大将满桂同时战死，名扬天下。孙仲寿文武全才，向为兄长的左右手，在此役中力战得脱，愤恨崇祯冤杀忠臣，和袁崇焕的旧部散在江湖，抚育幼主，密谋复仇。他精明多智，隐为袁党的首领。孙祖寿慷慨重义，忠勇廉洁，《明史》上记载了两个故事：孙祖寿镇守固关抗清时，出战受伤，濒于不起。他妻子张氏割下手臂上的肉，煮了汤给他喝，同时绝食七日七夜，祈祷上天，愿以身代。后来孙祖寿痊愈而张氏却死了。孙祖寿感念妻恩，终身不近妇人。
他身为大将时，有一名部将路过他昌平故乡，送了五百两银子到他家里。在当时原是十分寻常之事，但他儿子坚决不受。后来他儿子来到军中，他大为嘉奖，请儿子喝酒，说：“不受赠金，深得我心。倘苦你受了，这一次非军法从事不可。”《明史》称赞他“其秉义执节如此。”
孙仲寿为人处事颇有兄风，是以为众所钦佩。
注：明成祖应渤泥国苏丹之请，封其山为“长宁镇国山”，亲制碑文，并题诗一首，译意如下：“在热带的海上，是渤泥国所处的地方。人民亲近仁义，只有归顺，没有违逆。贤王勤恳谨慎，仰慕中华教化。大明管理外国的*员加以指导，就到中国来朝拜了，带了你的妃子、世子、兄弟、陪臣，来到大明宫殿阶下磕头，陈奏道：‘皇上就象是天一样，将温暖和愉乐普赐天下，对任何人都一样眷顾，没有偏爱，没有歧视。’但我自己反省，德行不够，没有你所说的这样伟大。你冒着风浪，远涉重洋，乘船来到，实在是很辛苦。查考历来远邦的臣属，归顺的时候就来朝拜，不服的时候就不来了，自己前来都不容易，何况还带了家室？你国王秉志贞诚，象金石一样坚固。西南各国的蕃邦君主，哪一位能及得上你？你国内有一座巍峨的高山，镇宁邦国。现在在石碑上刻了文字，以发扬你国王的美德。但愿你国王美德光大，国秦民安，今后千秋万岁，都归附我大明。”
